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歷史沿革
民國七十七年，金門縣仍屬實施戰地政務期間，縣之財政業務，仍由縣政府下設之財糧科掌理：科內分設財稅、糧政兩股辦事，置科長一員，股長二員，科員二員，辦事員一員，雇員一員，共七員。財糧科職掌財政籌措、公庫管理、稅務行政、基層金融管理、糧政、鹽政、物資調節、經濟檢查，及公營生產事業單位，包括酒廠、物資供應處、西園鹽場、金門電力公司、陶瓷廠、花崗石廠、港口檢查處、稅捐稽徵處之督導，舉凡民生所需，政府財用，市場調節，幾乎息息相關。
迫至民國八十一年十一月七日本縣終止戰地政務，縣政回歸地方自治常態，縣政府依福建省政府八十一年十一月五日訂定之「福建省金門縣連江縣實施地方自治綱要」第二十五條規定訂定之縣政府組織規程規定，財政科掌理財務行政、稅務行政、公庫、公產、公債、地方金融管理、糧鹽、燃料及其他有關財政等事項。依照上開修正組織規程之規定，縣政府之財政單位由「財糧科」修正為「財政科」，財政科下分為財務管理股、公有財產股，員額並未增加，仍置科長一員，股長二員，科員二人，辦事員一員，雇員一員，合計七員。民國八十四年二月，考量縣庫庫款庫支付與制度，與國家法令制度及台灣省各縣市作法不一，為革新財政制度，乃核定自民國八十四年七月一日起，實施庫款集中支付制度，以臨編組織增設「庫款支付股」一股，調用其他機關人員三人組成，股長一職由財管股長兼任。
民國八十八年一月二十五日總統令制定公布「地方制度法」，內政部依本法訂定之「地方行政機關組織準則」規定，縣政府之一級單位為局、室，局長之職等由現行薦任九職等提高為簡任第十至十一職等。財政科乃於民國八十九年一月一日依「福建省金門縣政府組織自治條例」之規定改制為「財政局」，下設財務管理、公有財產、庫款支付三課，並自民國九十三年八月起增設菸酒管理課，現置局長一員、專員一員、課長四員、課員三員、辦事員三員，共十二員。執掌財務行政、稅務行政、公產、公債、庫款支付、公庫、地方金融管理、菸酒管理及督導金酒公司業務等財政有關事務。
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